二穗短柄草中抗病基因家族的分析及機器學習預測方法研究

定　價：￥68.00

作　者：	譚生龍著
出版社：	重慶大學出版社
叢編項：
標　簽：	暫缺

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ISBN：	9787568921817	出版時間：	2020-12-01	包裝：	平裝
開本：	16開	頁數：	158	字數：

內容簡介

　　抗病基因對植物的生長發(fā)育起著非常重要的免疫調控作用，植物中抗病基因的數量和特征對該植物的抗病機制研究至關重要。本書選擇禾本科植物二穗短柄草作為研究對象，系統鑒定了該物種內最重要的一類抗病基因家族，這類抗病基因所編碼的蛋白具有核苷酸結合結構域（NBS，Nucleotide Binding Site）和亮氨酸重復結構域（LRR，Leucine—Rich Repeats），并系統分析了這些抗病基因。在獲得二穗短柄草中的NBS一LRR抗病基因列表后，繼續(xù)研究了其數字序列特征，并應用機器學習中的支持向量機算法對這些特征進行訓練建模，構建和優(yōu)化后的機器學習模型，可實現對其他已測序物種的快速抗病基因鑒定。本書可供基因分析及機器預測學習方法研究人員參考。

作者簡介

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圖書目錄

1 緒論
1.1 植物抗病基因概述
1.2 植物抗病基因研究中的生物信息學
1.3 常用生物信息學數據庫和分析軟件
1.4 本書的技術線路圖
1.5 本書的主要內容
1.6 本書的目的和意義
2 二穗短柄草抗病基因家族NBS.LRR的鑒定與生物信息學
分析
2.1 引言及研究動機
2.2 數據與方法
2.3 結果與分析
2.4 討論與小結
3 二穗短柄草NBS.LRR抗病基因家族的表達譜分析
3.1 引言及研究動機
3.2 基因表達譜分析的常用技術
3.3 實驗數據的獲取
3.4 結果與分析
3.5 討論與小結
4 NBS—LRR基因家族預測算法的設計與應用
4.1 研究背景
4.2 方法與數據集
4.3 結果與分析
5 總結與展望
5.1 主要研究結果
5.2 創(chuàng)新點
5.3 展望
附錄
附錄l 縮略詞簡表
附錄2 NBS—LRR抗病基因列表
附錄3 二穗短柄草中我們鑒定出的126個典型的NBS—LRR抗病基因的蛋白序列
附錄4 NBS一LRR抗病基因的基因簇分布
附錄5 氨基酸的部分理化性質簡表
附錄6 擬南芥中的正負樣本序列列表
附錄7 NBS—LRR抗病基因的蛋白序列結構域特征
參考文獻